近日,《自然》子刊《Nature Methods》上發(fā)表了一篇論文,而它立刻得到了《科學(xué)》官網(wǎng)的報道,這是重磅新聞才能享受的殊榮。這則被兩家頂尖學(xué)術(shù)期刊共同關(guān)注的研究出自 MIT 的著名科學(xué)家 Ed Boyden 教授之手。他的團隊發(fā)明的“大腦倍增術(shù)”將大腦尺寸擴大了 20 倍,讓神經(jīng)學(xué)家能在普通的光學(xué)顯微鏡下,以極高的分辨率觀察大腦結(jié)構(gòu),甚至清晰地分辨出不同的突觸蛋白。
▲Ed Boyden 教授是光遺傳學(xué)的奠基人之一,也因此為世人所熟知
對于生物學(xué)家來說,僅僅是將生物樣本放大,就足以獲得大量新知識。幾百年前,顯微鏡讓人類知道了細胞的存在。如今,更高級的顯微鏡則讓科學(xué)家們能看清細胞內(nèi)不同蛋白的運作。在日新月異的科技發(fā)展面前,MIT 生物工程系研究腦與認(rèn)知科學(xué)的 Boyden 教授有了一個新想法。“我們想要了解整個大腦回路的布局,”他說道:“如果你能重建出一個完整的大腦回路,或許你就能利用計算模型,了解大腦是如何產(chǎn)生情感或是做出決定。當(dāng)你了解到每一個生物分子的布局、細胞如何產(chǎn)生電信號、并且怎樣交換化學(xué)物質(zhì)后,你就有能力去模擬整個大腦。”
然而大腦本身卻不是一個適合觀察的器官。它總體而言不透明,細胞與細胞之間排列組合錯綜復(fù)雜。利用現(xiàn)有的共聚焦顯微鏡(confocal microscope),科學(xué)家們能觀察到的分辨率只有幾百納米。
▲科學(xué)家們希望有朝一日能還原出整個大腦回路的布局
如果直接觀察這些組織過于困難,我們?yōu)樯恫荒馨堰@些組織變得更大呢?MIT 的科學(xué)家們想到了一種叫做聚丙烯酸酯的材料。這是一類高吸水性的分子,最常見的用途之一是嬰兒尿布。在吸收了嬰兒的尿液后,它的體積會擴大很多倍。研究人員意識到,這一特性也許能被用來擴大大腦樣本的體積。
在一項實驗中,研究人員將大腦樣本包埋在了這類分子中,并用帶有熒光的標(biāo)記分子去識別特定的蛋白靶點。等到這些標(biāo)記分子就位后,研究人員用蛋白酶清除樣品中的蛋白質(zhì)(包括那些讓組織粘連在一起的蛋白),然后給樣本加上了水。在吸收水分后,隨著吸水性材料的不斷膨脹,大腦樣本也隨之慢慢擴大。在此過程中,那些熒光標(biāo)記分子依舊保持著各自相對的位置,從而反映了大腦樣本原有的結(jié)構(gòu)。利用未被蛋白酶降解的標(biāo)記分子留下的熒光,研究人員就能估算出大腦樣本擴大的倍數(shù)。
這種簡單的方法能在線性維度上,將大腦擴大 4.5 倍。這一看似微小的變化,能將分辨率從幾百納米提高到 60 納米。在共聚焦顯微鏡下,原本模糊一片的樣品,變得無比清晰。
▲尿布材料讓大腦樣本變得清晰無比
這是一個巨大的突破——它首次讓科學(xué)家們能以常規(guī)的光學(xué)顯微鏡,達到只有昂貴的顯微鏡才能看到的效果。但研究人員對此依舊不滿意。“單獨的生物分子還要小,它們只有 5 納米,甚至更小,” Boyden 教授說道:“這套技術(shù)能回答許多科學(xué)上的問題,但和電子顯微鏡等清晰度的成像手段還無法同日而語。”因此,研究人員并沒有停下腳步,而是繼續(xù)鉆研讓放大倍數(shù)繼續(xù)增加的可能性。
在一些初步的實驗中,研究人員發(fā)現(xiàn),如果減少把這些吸水分子鏈接起來的交聯(lián)物,大腦的體積就能得到進一步擴大。這就好像較薄的氣球更容易被吹起來一樣,很容易理解。但容易吹起來的氣球也容易破,這套系統(tǒng)也有同樣的問題。如果減少這些交聯(lián)物,大腦結(jié)構(gòu)會在膨脹的過程中變得不穩(wěn)定,甚至是亂七八糟。這可不是研究人員想看到的。
“如果你減少交聯(lián)物的密度,這些多聚體就不能在膨脹過程中很好地保持自身的結(jié)構(gòu),” Boyden 教授評論說:“很多信息就這樣丟失掉了。”
▲第二種凝膠讓大腦樣本得以進一步擴大
那有什么辦法能讓大腦組織在膨脹的過程中保持結(jié)構(gòu)穩(wěn)定呢?研究人員用上了另一種特殊的凝膠——在大腦樣本隨著吸水分子的膨脹而倍增后,研究人員把這些樣本放到了特殊的凝膠里,讓凝膠去破壞原有吸水分子間的交聯(lián)。但與此同時,這種凝膠的特性讓大腦的結(jié)構(gòu)依舊保持穩(wěn)定。隨后,研究人員再次讓這些樣本膨脹,進一步放大它的尺寸。
這樣一來,大腦樣本的尺寸能被額外擴大 4 倍左右。換句話說,普通大腦樣本的尺寸在線性維度上能被擴大到 20 倍左右,分辨率達到了 25 納米。
▲用常規(guī)的顯微鏡,人們首次能以如此高的清晰度看到大腦內(nèi)的結(jié)構(gòu)
這與目前的一些高級顯微鏡能達到的分辨率旗鼓相當(dāng)。但這套技術(shù)的成本要低得多,實際操作上更方便,也不需要特殊的試劑和儀器。
利用這套技術(shù),研究人員不但能看到影響突觸內(nèi)數(shù)百種蛋白結(jié)構(gòu)的支架蛋白,更能清楚地觀察到神經(jīng)遞質(zhì)受體在突觸后細胞表面上的分布。這些觀察結(jié)果有助于神經(jīng)科學(xué)領(lǐng)域的最新研究。
盡管離還原整個大腦的布局還有一定距離,但 Boyden 教授對此表示樂觀。他認(rèn)為在接下來的幾年,他們有望從突觸的支架蛋白和信號蛋白入手,開始還原它們在大腦中的布局。這一前景讓人感到興奮。
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