細胞周期修復,是腫瘤細胞持續(xù)存活的關鍵步驟,打破這種平衡,是殺死腫瘤細胞的重要手段。CDKs蛋白家族抑制劑的治療效果,已于近5年獲得了足夠的臨床證實,CDK4/6更是逐漸成為腫瘤領域的經(jīng)典靶標,那么,細胞周期過程中的另一關鍵因子CDK2,當前開發(fā)狀態(tài)如何?賽道是否擁堵?研發(fā)方是否值得跟進?請看本稿件。
01 CDKs于腫瘤環(huán)境中的作用特點
惡性腫瘤通常具有以下特征:細胞凋亡程序失活、新生血管的形成、免疫監(jiān)視逃避、非生理性生長信號/抑制信號的放大、異常的黏附功能、細胞永生化等。
其中,靶向調(diào)控腫瘤細胞周期以改變腫瘤細胞的凋亡狀態(tài),臨床已被證實有效,具體代表性品種即為CDK家族抑制劑。
CDK家族靶點,主要分為兩大類,一是參與細胞周期調(diào)控,相關有絲分裂,亞型代表有CDK1、2、4、6;另一類主要參與轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié),調(diào)節(jié)RNA聚合酶II的磷酸化修飾,亞型代表有CDK7、8、9、11;具體見下圖。
主要CDK及其功能示意圖(參考:藥學進展/2015)
02 CDK2靶點機制
在有絲分裂信號的刺激下,細胞由G0期進入到有絲分裂Gl期,細胞內(nèi)部活動逐漸上調(diào)。CDK4/6與cyclinD結(jié)合,促使視網(wǎng)膜母細胞瘤蛋白(Rb)磷酸化,部分轉(zhuǎn)錄延展因子E2F的活性得以釋放,用于合成大量的RNA與蛋白質(zhì),為染色體復制做準備。
G1后期,CDK2與cyclinE結(jié)合形成蛋白酶體復合物CDK2-cyclinE并活化,促使Rb進一步磷酸化,誘導轉(zhuǎn)錄因子E2F的持續(xù)表達,從而調(diào)控細胞順利通過G1期。進入S期后,CDK2與cyclinA結(jié)合形成復合物CDK2-cyclinA參與到細胞周期S期的進程,完成DNA的復制。
隨后,cyclinA/B與CDK1形成CDK1-cyclinA/B復合物,驅(qū)動細胞周期進入G2/M期,合成RNA與蛋白質(zhì)為紡錘絲的形成做準備。最終,細胞有序地經(jīng)過G1-S-G2-M所有細胞周期完成細胞的有絲分裂。
CDK2調(diào)節(jié)有絲分裂過程(中國細胞生物學學報/2021)
結(jié)構(gòu)上,CDK2蛋白高度保守,由298個氨基酸組成,蛋白折疊呈雙葉狀,ATP結(jié)合區(qū)就位于這兩個“葉狀”之間的深裂,決定著ATP或者蛋白結(jié)合底物與CDK2的特異性結(jié)合,在細胞調(diào)控機制中起關鍵作用。
圖2.1 CDK2-3D結(jié)構(gòu)(PDB:1HCL)
03 CDK2臨床在研藥物
1990s起,CDK2抑制劑的開發(fā)即已經(jīng)有品種進入到臨床階段,但幾乎都以多靶點抑制劑為主。
正構(gòu)方向,CDK2中的Ilel0、Vall8、Ala31、Lys33、Phe80、Glu81、Phe8、Leu83、His84、Gln85、Asp86、Lys89、Glnl31、Leul34、Alal44和Aspl45等位點,在結(jié)合ATP的過程中發(fā)揮著至關重要的作用。
但由于ATP結(jié)合口袋在CDK蛋白家族中的高度保守,使得針對ATP結(jié)合口袋開發(fā)選擇性CDK2抑制劑較為困難,故非ATP結(jié)合的別構(gòu)抑制劑也在開發(fā)當中,且已發(fā)現(xiàn)2個抑制劑新結(jié)合口袋:
1)由Leu55、Lys56、Phe80、Asp145、Phe146和Lys33組成,位于ATP結(jié)合位點和C-端螺旋的中間;
2)由Leu124、Phe152、Val154-156、Glu172、Gly176、Thr182、Val184、Val227-230、Ser232-234和Asp270-Asn272組成。
Dinaciclib(III期)
開發(fā)公司為默沙東,為CDK1/2/5/9抑制劑,目前處在臨床III期用于治療難治愈的慢性淋巴細胞白血病。2011年,F(xiàn)DA授予Dinaciclib治療CLL孤兒藥資格。該品種對CDK2、CDK5、CDK1和CDK9均有抑制活性,IC50分別為1nM、1nM、3nM和4nM;臨床研究結(jié)果表明,Dinaciclib與利妥昔單抗聯(lián)合用藥治療復發(fā)性慢性淋巴細胞性白血病時,患者的耐受性良好。
Seliciclib(II期)
開發(fā)公司為Cyclacel Pharmaceuticals,是CYC-200系列口服小分子細胞周期蛋白依賴性激酶(CDK1/2/5/7)抑制劑的先導化合物,已在超過100種細胞系中進行了抗增殖活性的測定,目前處于臨床II期,用于治療B淋巴細胞白血病,與吉西他濱/順鉑聯(lián)合使用作為一線用藥治療非小細胞肺癌。另,公司還在研究該藥物用于潛在治療與SARS-CoV-2感染(COVID-19)相關的炎癥。
PF-07104091(I/II期)
開發(fā)公司為輝瑞,屬CDK2選擇性抑制劑,口服用于多種癌癥的治療,包括乳腺癌、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、卵巢癌等。2020年9月,啟動了晚期SCLC、晚期上皮性卵巢/輸卵管/原發(fā)性腹膜癌、晚期乳腺癌和晚期NSCLC的I/II期試驗;2020年10月,公司將該藥物列為轉(zhuǎn)移性乳腺癌的I期試驗。2021年4月,臨床前數(shù)據(jù)在第112屆AACR年會上公布:OVCAR3模型中,PF-07104091(25、75和175mg/kg,po,bid)表現(xiàn)出劑量依賴性腫瘤減少,最 大作用為86%;CCNE1(high)卵巢模型(OV5392)中,PF-07104091(75和150mg/kg,po,bid)顯示出類似于在OVCAR-3中觀察到的腫瘤生長抑制;NCI-H526細胞(Rb(mut))SCLC模型中,PF-07104091(25、75、175或150mg/kg,po,bid)表現(xiàn)出單一藥物活性;ER+HER2-乳腺癌細胞系中,PF-07104091和palbociclib表現(xiàn)出協(xié)同的細胞生長抑制作用;T47D模型中,PF-07104091(150mg/kg,po,bid)+palbociclib(10mg/kg,po,bid)表現(xiàn)出聯(lián)用效果。
Ebvaciclib(I/II期)
開發(fā)公司為輝瑞,為一種CDK2/4/6抑制劑;2018年11月,在愛爾蘭都柏林舉行的第30屆AACR年會上,首次公布了Ebvaciclib的體外和體內(nèi)數(shù)據(jù);Ebvaciclib對CDK2、4、5和6的結(jié)合親和力較高,較脫靶的CDK1和CDK9高40倍。2018年3月,在接受過CDK4/6抑制劑治療和HR陽性HER2陰性乳腺癌、轉(zhuǎn)移性三陰性乳腺癌或晚期鉑耐藥性上皮性卵巢癌/輸卵管癌的難治/復發(fā)患者中啟動了I/II期試驗,預計在2021年獲得試驗數(shù)據(jù)。
Fadraciclib(I期)
開發(fā)公司為Cyclacel Pharmaceuticals,一種CDK2/9抑制劑,靜脈注射用于治療晚期癌癥,包括慢性淋巴細胞白血病、急性髓系白血病和骨髓增生異常綜合征。2018年4月,臨床前數(shù)據(jù)在芝加哥舉行的第109屆AACR年會上公布;2018年11月,啟動復發(fā)或難治性CLL的臨床I期試驗;2019年7月,啟動復發(fā)或難治性AML和MDS的臨床I期試驗。
NUV-422(I/II期)
開發(fā)公司為Nuvation Bio,為CDK2/4/6抑制劑,臨床開發(fā)用于膠質(zhì)瘤的治療。2020年11月,啟動一項針對復發(fā)或難治性高級別膠質(zhì)瘤成人患者的I/II期試驗;2021年2月,該公司計劃在啟動腦轉(zhuǎn)移I期試驗,之后啟動腦轉(zhuǎn)移、雌激素受體陽性轉(zhuǎn)移性乳腺癌的I期試驗,再之后啟動轉(zhuǎn)移性去勢耐藥前列腺癌的I期試驗。
圖3.2 CDK2抑制劑部分化學結(jié)構(gòu)
04 國內(nèi)研發(fā)跟進狀態(tài)
通過專利查詢,國內(nèi)對于CDK2抑制劑的開發(fā):國外申請人主要有艾文蒂斯藥品公司、霍夫曼-拉羅奇有限公司,等;國內(nèi)申請人主要有中國藥科大學、四川大學、濱州醫(yī)學院、常州大學、江南大學,等。由此不難看出,目前國內(nèi)對于該靶點的品種,尚無大量藥企進行跟進,賽道通暢。
參考文獻:
1.Targeting CDK2 in cancer: challenges and opportunities for therapy. Drug Discovery Today. doi.org/10.1016/j.drudis.2019.12.001.
2.To control or to be controlled? Dual roles of CDK2 in DNA damage and DNA damage response. DNA Repair. doi.org/10.1016/j.dnarep.2019.102702.
3.細胞周期蛋白依賴性激酶2的功能及其抑制劑的研究. 中國細胞生物學學報/2021.
4.CDK 抑制劑在抗腫瘤領域的研發(fā)進展.藥學進展/2015.
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