流感,是一種由傳播快、易變異的流感病毒引起的常見呼吸道傳染病。據(jù)世界衛(wèi)生組織(WHO)數(shù)據(jù)顯示,每年全球大約有 10 億例季節(jié)性流感病例。接種疫苗是防控流感最經(jīng)濟(jì)有效的手段之一,“下一代疫苗的開發(fā)”在 2021 年被《科學(xué)》雜志列為 125 個前沿科學(xué)問題之一。
2025 年 1 月 15 日,中國科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院合成生物學(xué)研究所司龍龍團(tuán)隊在 Nature 子刊 Nature Microbiology 和 Nature Chemical Biology 上同期發(fā)表兩項(xiàng)重要研究成果。論文題目分別是:Proteolysis-targeting influenza vaccine strains induce broad-spectrum immunity and in vivo protection 和 PROTAR Vaccine 2.0 generates influenza vaccines by degrading multiple viral proteins.
研究團(tuán)隊聚焦減毒活疫苗研發(fā)的關(guān)鍵共性難題,基于該團(tuán)隊前期建立的第一代蛋白降解靶向的減毒疫苗技術(shù)(簡稱“PROTAR 疫苗技術(shù)”),從介導(dǎo)病毒蛋白降解的 E3 泛素連接酶的多樣性、病毒蛋白和氨基酸位點(diǎn)的多樣性兩個方面,對 PROTAR 疫苗技術(shù)進(jìn)行優(yōu)化迭代,分別建立了 PROTAR 流感疫苗庫和第二代 PROTAR 疫苗技術(shù),為更加安全、有效的減毒活疫苗開發(fā)提供了新思路。
中國科學(xué)院院士高福評價道,該工作極大豐富了 PROTAR 流感減毒活疫苗的多樣性,支撐 PROTAR 活疫苗系統(tǒng)評價與優(yōu)化,拓展了人們對 PROTAR 減毒活疫苗的認(rèn)知,該團(tuán)隊在 PROTAR 減毒活疫苗研究方向上的連續(xù)性工作為包括流感在內(nèi)的多種流行性病毒的減毒活疫苗設(shè)計提供了新思路、新方法。
建立 PROTAR 流感疫苗庫,拓展疫苗多樣性
傳統(tǒng)疫苗存在諸多局限,一方面,部分傳統(tǒng)疫苗免疫效果欠佳,難以應(yīng)對病毒頻繁變異;另一方面,一些疫苗安全性令人擔(dān)憂,可能引發(fā)嚴(yán)重不良反應(yīng)。此外,部分疫苗研制技術(shù)復(fù)雜、通用性差,研發(fā)周期長且高度依賴研究人員經(jīng)驗(yàn),也極大限制了疫苗的快速生產(chǎn)與廣泛應(yīng)用。
2022年,司龍龍團(tuán)隊提出了 PROTAR 減毒活疫苗技術(shù),相關(guān)成果發(fā)表于 Nature Biotechnology 期刊。
為進(jìn)一步提升疫苗效用及安全性,在此次發(fā)表于 Nature Microbiology 期刊的新研究中,司龍龍團(tuán)隊基于前期研究,建立了 PROTAR 疫苗庫,拓展了 PROTAR 疫苗多樣性。
病毒組裝自身結(jié)構(gòu)和行使生物學(xué)功能,很大程度上依賴病毒蛋白。研究團(tuán)隊設(shè)計出了獨(dú)特的“生命開關(guān)”元件——PTD,得以調(diào)控病毒蛋白的穩(wěn)定或降解。
司龍龍研究員表示,PROTAR 疫苗技術(shù)的設(shè)計原理是利用細(xì)胞中的蛋白質(zhì)降解機(jī)器——“泛素-蛋白酶體系統(tǒng)”,將“生命開關(guān)”元件 PTD 引入至病毒蛋白兩端,使得病毒在進(jìn)入正常細(xì)胞后,病毒蛋白被系統(tǒng)識別并降解,導(dǎo)致病毒復(fù)制能力減弱,實(shí)現(xiàn)病毒“減毒”,從而將病毒變成潛在疫苗。
另一方面,為實(shí)現(xiàn)疫苗的高效制備,團(tuán)隊還創(chuàng)新性地設(shè)計出了系統(tǒng)功能缺陷的工程細(xì)胞。通過選擇性移除“生命開關(guān)”元件 PTD,病毒蛋白得以保留并穩(wěn)定存在,使得 PROTAR 疫苗可以在疫苗制備細(xì)胞中高效復(fù)制,滿足大量制備的需求。
在 PROTAR 疫苗設(shè)計中,病毒蛋白的特異性降解由 PTD 以及其對應(yīng)的 E3 泛素連接酶決定。目前,在真核細(xì)胞中已經(jīng)鑒定出超過 600 種 E3 泛素連接酶,為 PROTAR 疫苗的多樣性設(shè)計提供了生物學(xué)基礎(chǔ)。
司龍龍團(tuán)隊以流感病毒為研究模型,利用 E3 泛素連接酶的多樣性,設(shè)計并成功構(gòu)建了 22 類 PROTAR 疫苗株,拓展了 PROTAR 疫苗的種類,并展示出 PROTAR 疫苗的多樣性。
此外,團(tuán)隊對 PROTAR 疫苗的安全性、免疫原性、免疫保護(hù)效果進(jìn)行了系統(tǒng)性的驗(yàn)證及評價,為開發(fā)更優(yōu)的、具有臨床轉(zhuǎn)化潛力的 PROTAR 疫苗候選株奠定基礎(chǔ),有望促進(jìn) PROTAR 疫苗技術(shù)的推廣應(yīng)用和臨床轉(zhuǎn)化。
PROTAR 疫苗 2.0,提升疫苗技術(shù)靈活通用性
司龍龍團(tuán)隊開發(fā)的第一代 PROTAR 疫苗技術(shù)雖然顯示出良好的潛力,但該技術(shù)僅允許“生命開關(guān)”元件 PTD 裝載在病毒蛋白兩端(N端和C端),可能會限制技術(shù)在不同病毒中的廣泛應(yīng)用。
司龍龍團(tuán)隊在發(fā)表于 Nature Chemical Biology 的新研究中,將該技術(shù)進(jìn)一步升級,開發(fā)了 PROTAR 疫苗 2.0,可支持 PTD 元件裝載在病毒蛋白的任意合適的位點(diǎn),包括病毒蛋白兩端和內(nèi)部位點(diǎn),有效地彌補(bǔ)了第一代 PROTAR 疫苗技術(shù)的缺陷。
這一技術(shù)的改進(jìn),不僅為 PTD 元件在病毒蛋白中的裝載提供了大量位點(diǎn)選擇空間,提高了技術(shù)靈活性和通用性,還能實(shí)現(xiàn)多個 PTD 元件在同一病毒顆粒中的同時裝載,從而提升疫苗的安全性。
在犬腎細(xì)胞(MDCK細(xì)胞)、小鼠模型、雪貂模型的驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)中,研究團(tuán)隊證明了 PROTAR 疫苗 2.0 具有良好的安全性、免疫原性、交叉免疫保護(hù)效果;并進(jìn)一步地在多種流感病毒中證明了其通用性,有望推廣至其他病毒疫苗的研制。
總的來說,司龍龍團(tuán)隊建立的 PROTAR 流感疫苗庫拓展了疫苗種類,豐富了人類防控病毒性流行性傳染病的“武器庫”。此外,開發(fā)的 PROTAR 疫苗 2.0 通過提升技術(shù)的靈活性和通用性,有望推動流感疫苗安全性及有效性的升級,為防控流感和疫苗研發(fā)具有重要的科學(xué)和應(yīng)用價值。該兩項(xiàng)研究成果為流感疫苗研發(fā)提供了新思路。
中國科學(xué)院院士趙國屏評價道,合成生物學(xué)作為一門新興的交叉學(xué)科,借鑒工程學(xué)原理,設(shè)計改造天然生物系統(tǒng),或合成新的生物體系,揭示生命運(yùn)行規(guī)律(造物致知),變革生物體系工程化應(yīng)用(造物致用),在食品、醫(yī)藥、能源、環(huán)境、材料、農(nóng)業(yè)等領(lǐng)域發(fā)揮著越來越重要的作用。該工作基于合成生物學(xué)研發(fā)新型疫苗技術(shù),豐富了人們對抗傳染性疾病的武器庫,是合成生物學(xué)推動生物醫(yī)藥發(fā)展的成功范例。
論文鏈接:
1. https://www.nature.com/articles/s41564-024-01908-2
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